1.5 多人在线协作R开发RStudio Server

问题

R语言开发，哪个工具最好用？

引言

RStudio是R语言开发中的利器，是最好用的R语言IDE集成环境。RStudio Server，更是利器中的神器。不仅提供了Web的功能，可以安装到远程服务器上，通过Web进行访问，还支持多用户的协作开发。如此神器，快来动手试一下吧。

1.5.1 RStudio和RStudio Server

RStudio 是一个强大的、免费的、开源的R语言集成开发环境的应用软件，可以安装在Windows, Linux, Mac 不同操作系统上。RStudio Server 是一个基于Web访问的RStudio云端开发环境，需要安装在Linux服务器上面，支持多用户远程访问使用。

1.5.2 RStudio Server安装

本文使用的系统环境是：

  • Linux: Ubuntu Server 12.04.2 LTS 64bit
  • R: 3.0.1 x86_64-pc-linux-gnu
  • IP: 192.168.1.13

注：RStudio Server只支持Linux系统环境。

在Linux Ubuntu环境中，下载并安装64位的 rstudio-server：
~ sudo apt-get install gdebi-core
~ sudo apt-get install libapparmor1  # Required only for Ubuntu, not Debian
~ wget <http://download2.rstudio.org/rstudio-server-0.97.551-amd64.deb>
~ sudo gdebi rstudio-server-0.97.551-amd64.deb

注：下载最新版本RStudio Server的地址是http://www.rstudio.com/ide/download/server.html

安装后，RStudio Server会自动启动运行。

~ ps -aux|grep rstudio-server  # 查看RStudio Server运行进程
998       2914  0.0  0.1 192884  2568 ?        Ssl  10:40   0:00 /usr/lib/rstudio-server/bin/rserver

可以看到，RStudio Server的服务已启动，8787端口被打开。

1.5.3 RStudio Server使用

通过浏览器，我们访问RStudio Server: http://192.168.1.13:8787，IP地址为RStudio Server服务器的地址，如图1-6所示。

RStudio Server登陆界面

图1-6 RStudio Server登陆界面

RStudio Server 登陆需要用Linux 系统的用户账号。如果想增加或减少用户，直接对Linux系统用户进行操作就可以了。我的环境中用户登陆，用户名是conan，密码是conan111。登陆之后看到的界面如图1-7所示。

RStudio Server的Web界面

图1-7 RStudio Server的Web界面。

1. RStudio Server 的系统配置

RStudio Server主要有两个配置文件，默认文件不存在。

/etc/rstudio/rserver.conf
/etc/rstudio/rsession.conf

设置端口和ip控制：

~ vi /etc/rstudio/rserver.conf
www-port=8080  # 监听端口
www-address=127.0.0.1  # 允许访问的IP地址，默认为0.0.0.0
重启rstudio-server，配置生效：
~ sudo rstudio-server restart

会话配置管理：

~ vi /etc/rstudio/rsession.conf
session-timeout-minutes=30  # 会话超时时间
r-cran-repos=http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/  # 设置CRAN资源库

2. RStudio Server 的系统管理

启动、停止、重启 RStudio Server服务器的命令如下：

~ sudo rstudio-server start  # 启动
~ sudo rstudio-server stop  # 停止
~ sudo rstudio-server restart  # 重启

查看运行中的R进程：

~ sudo rstudio-server active-sessions
PID     TIME COMMAND
6817 00:00:03 /usr/lib/rstudio-server/bin/rsession -u zd

指定PID, 停止运行中的R进程：

~ sudo  rstudio-server suspend-session 6817
~ sudo rstudio-server active-sessions  # 再次查看进程
 PID     TIME COMMAND

停止所有运行中的R进程：

~ sudo rstudio-server suspend-all

强制停止运行中的R进程，此操作优先级最高，立刻执行。

~ sudo rstudio-server force-suspend-session <pid>
~ sudo rstudio-server force-suspend-all

RStudio Server临时下线，不允许web访问，并给用户友好的错误提示：

~ sudo rstudio-server offline
rstudio-server start/running, process 6880

RStudio Server上线：

~ sudo rstudio-server online
rstudio-server start/running, process 6908

RStudio Server的其他操作和单机版的RStudio一样。

1.5.4 RStudio Server多人协作

1. 增加新用户和新用户组

~ sudo groupadd hadoop  # 创建hadoop用户组
~ sudo useradd hadoop -g hadoop  # 创建hadoop用户并加入到hadoop用户组
~ sudo passwd hadoop  # 设置hadoop用户的密码
~ sudo adduser hadoop sudo  # 增加hadoop用户到sudo组
~ sudo mkdir /home/hadoop  # 创建hadoop用户的home目录
~ sudo chown -R hadoop:hadoop /home/hadoop  # 给/home/hadoop目录及子目录，设置用户权限

以hadoop用户登陆，检查用户是否设置成功

~ ssh hadoop@localhost  # 通过 ssh 远程登陆
~ bash
~ pwd  # 查看登陆后的访问目录
/home/hadoop

新打开浏览器窗口通过 hadoop账号登陆 ，如图1-8所示。

以hadoop账号登陆

图1-8 以hadoop账号登陆

2. Git代码共享

首先安装git：

~ sudo apt-get install git
~ ssh-keygen -t rsa  #生成rsa密钥对
~ cat /home/conan/.ssh/id_rsa.pub  #查看公钥
ssh-rsa AAAAB3NzaC1yc2EAAAADAQABAAABAQDMmnFyZe2RHpXaGmENdH9kSyDyVzRas4GtRwMNx+qQ4QsB8xVTrIbFayG2ilt+P8UUkVYO0qtUJIaLRjGy/SvQzzL7JKX12+VyYoKTfKvZZnANJ414d6oZpbDwsC0Z7JARcWsFyTW1KxOMyesmzNNdB+F3bYN9sYNiTkOeVNVYmEQ8aXywn4kcljBhVpT8PbuHl5eadSLt5zpN6bcX7tlquuTlRpLi1e4K+8jQo67H54FuDyrPLUYtVaiTNT/xWN6IU+DQ9CbfykJ0hrfDU1d1LiLQ4K2Fdg+vcKtB7Wxez2wKjsxb4Cb8TLSbXdIKEwSOFooINw25g/Aamv/nVvW1 conan@conan-deskop

把公钥上传到Github账户中进行绑定。

接下来，我们需要把本地项目上传到Github。在Github上创建一个新的项目rstudio-demo，地址为https://github.com/bsspirit/rstudio-demo，通过下面的操作上传本地目录到rstudio-demo项目。

~ mkdir /home/conan/R/github  # 创建rstudio-demo项目目录
~ cd /home/conan/R/github
~ git init  # 初始化git
~ git add  # 增加当前目录及子目录到本地git库
~ git commit -m 'first comment'  # 在本地git库提交
~ git remote add origin git@github.com:bsspirit/rstudio-demo.git  # 绑定当前目录和github的项目
~ git push -u origin master  # 上传本地git库中的代码到github

打开RStudio设置到/home/conan/R/github目录，tools–>version control –> project setup，如图1-9所示。

在RStudio中，配置github地址

图1-9 在RStudio中，配置github地址

在RStudio中修改sayHello.r的代码

sayHello<-function(name){
  print(paste("hello",name))
}

sayHello("Conan")
sayHello("World")

提交：点击tools–>version control–> commit ，如图1-10所示。

通过RStudio进行git操作

图1-10 通过RStudio进行git操作

上传到github，只需要点击tools–>version control–> push，如图1-11所示。

在Github上查看提交的操作

图1-11 在Github上查看提交的操作

RStudio有如此强大的功能，极大地降低了编程的门槛。还没有用过的同学，赶紧去体验一把吧。极客的感觉！

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